18+

 

Номер №2, 2024 - стр. 36-44

Структура микробиоты фертильных и инфертильных пациентов с различными видами азооспермии DOI: 10.29188/2222-8543-2024-17-2-36-44

Для цитирования: Фаниев М.В., Кадыров З.А., Дружинина Н.К., Степанов В.С., Прокопьев Я.В., Федоренко Т.В., Маркелова М.И., Хуснутдинова Д.Р., Григорьева Т.В. Cтруктура микробиоты фертильных и инфертильных пациентов с различными видами азооспермии. Экспериментальная и клиническая урология 2024;17(2):36-44; https://doi.org/10.29188/2222-8543-2024-17-2-36-44
Faniev M.V., Kadyrov Z.A., Druzhinina N.K., Stepanov V.S., Prokop'ev Ya.V., Fedorenko T.V., Markelova M.I., Husnutdinova D.R., Grigor'eva T.V.
Сведения об авторах:
  • Фаниев М.В. – к.м.н., доцент кафедры эндоскопической урологии РУДН; Москва, Россия; РИНЦ Author ID 1056145, https://orcid.org/0000-0002-7323-3126
  • Кадыров З.А. – д.м.н., профессор, заведующий кафедрой эндоскопической урологии РУДН; Москва, Россия; РИНЦ Author ID 721133, https://orcid.org/0000-0002-1108-8138
  • Дружинина Н.К. – аспирантка кафедры эндоскопической урологии и ультразвуковой диагностики факультета непрерывного медицинского образования медицинского института РУДН; Москва; Россия; РИНЦ Autor ID 1074829, https://orcid.org/0000-0003-3277-6068
  • Степанов В.С – ведущий специалист уролог медицинского холдинга СМ Клиника; Москва, Россия; https://orcid.org/0000-0003-0525-3026
  • Прокопьев Я.В. – к.м.н., доцент кафедры урологии и нефрологии Казанской государственной медицинской академии – филиал ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Минздрава России; Казань, Россия; РИНЦ Author ID 1066425, https://orcid.org/0000-0002-4345-127X
  • Федоренко Т.В. – к.б.н., биолог лаборатории клеточных технологий центра репродуктивной и клеточной медицины диагностического центра ГБУЗ «ДГКБ г. Краснодар» МЗ КК; Краснодар, Россия; РИНЦ Author ID 706354, https://orcid.org/0009-0008-9780-4158
  • Маркелова М.И – младший научный сотрудник OpenLab «Омиксные технологии» Института фундаментальной медицины и биологии ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет»; Казань, Россия; РИНЦ Author ID 976359, https://orcid.org/0000-0001-7445-2091
  • Хуснутдинова Д.Р. – главный инженер проекта Междисциплинарного центра протеомных исследований Института фундаментальной медицины и биологии ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет»; Казань, Россия; РИНЦ Author ID 877569, https://orcid.org/0000-0002-9982-9059
  • Григорьева Т.В – к.б.н, старший научный сотрудник OpenLab «Омиксные технологии» Института фундаментальной медицины и биологии ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет»; Казань, Россия; Author ID 616577, https://orcid.org/0000-0001-5314-7012
195

Введение. Исследование микробиома человека стало темой, вызывающей все больший научный интерес. Сбалансированная и разнообразная мик- робиота мужской половой системы необходима для оптимального репродуктивного здоровья. Сегодня нет диагностических тестов, позволяющих определить влияние конкретных микроорганизмов на качество семенной жидкости, однако, применение секвенирования нового поколения (NGS), использующего в качестве молекулярного маркера последовательность гена 16S рРНК, предоставляет нам возможность понять всю сложность взаимоотношений микробиома и его хозяина.

Цель. Провести сравнительный анализ таксономической структуры микробиоты пациентов с обструктивной и необструктивной азооспермией и группой фертильности (пациенты с рожденными детьми в анамнезе).

Материалы и методы. В исследование вошли 57 человек. Все пациенты ретроспективно были распределены на три группы: группа 1 (n=29) – пациенты с необструктивной азооспермией (НОА) и отсутствием детей; группа 2 (n=19) – пациенты с обструктивной азооспермией (ОА); группа 3 (n=9) – фертильные пациенты (FERT). Всем пациентам была выполнена микроскопическая биопсия яичка (micro-TESE) с последующим проведением экстракорпорального оплодотворения по технологии интрацитоплазматической инъекции сперматозоида (ИКСИ), либо криоконсервации биологического материала. Был проведен анализ ампликонов бактериального гена 16S pРНК с использованием высокопроизводительного секвенирования нового поколения (NGS). Для исследования бактериального пейзажа урогенитального тракта и контроля чистоты метода был произведен забор биологического материала из уретры у каждого пациента, которому проводилась биопсия яичка. Данные обрабатывали с помощью программы QIIME (версия 1.9.1).

Результаты. Достоверных отличий в группах сравнения при исследовании бактериального пейзажа уретры не обнаружено. Видовое разнообразие микробиоты тестикулятной ткани, а также общее количество обнаруженных таксономических единиц (ОТЕ) в группах НОА и ОА достоверно ниже, чем в группе ФЕРТ. Различается представленность фил Proteobacteria, Firmicute, Bacteroidetes, Bifidobacterium adolescentis в исследуемых группах. При сравнении таксономического состава микробиоты тестикулярной ткани и уретры выявлено три микроорганизма, представленных с одинаковой частотой (использовался точный критерий Фишера с поправкой на множественное сравнение методом Бенджамини-Хохберга). Различается представленность фил Prevotella, Comamonadaceae, Veillonella dispa, Comamonadaceae в исследуемых группах.

Выводы. Тестикулярная ткань нестерильна и имеет свой неповторимый микробный пейзаж для каждой группы сравнения. Бактериальные сообщества ткани яичка у пациентов с азооспермией характеризуются пониженным разнообразием и специфическим составом, отличающимся от микробиоты уретры. Данные результаты могут быть полезны при дальнейшем изучении роли микробиоты в патологии сперматогенеза и разработке новых подходов к лечению и диагностике мужского бесплодия.

AttachmentSize
Скачать статью2.7 MB
микробиом; азооспермия; мужское бесплодие; секвенирования нового поколения (NGS); 16S рРНК

Readera - Социальная платформа публикаций

Crossref makes research outputs easy to find, cite, link, and assess